Non si ha notizia di eventi storici particolarmente significativi che la riguardano. Il toponimo è riferito alla presenza all'ingresso dell'abitato di un vecchio edificio, chiamato spregiativamente Casaccia. Anticamente non aveva l'estensione attuale perché le due località di Mologno e di Molini di Colognola costituivano due comuni autonomi. Benché la loro fusione fosse stata disposta già da Napoleone, i due comuni si separarono nuovamente nel 1815, per essere riunificati definitivamente soltanto dopo più di un secolo, nel 1927. Fino al X secolo Mologno si chiamò Cavalla o Cavallas, probabilmente perché posta a cavallo della zona, e da questo toponimo deriva probabilmente quello dell'intera valle. La sua storia segue le linee di quella di tanti altri comuni vicini, al pari dei quali passò, nel corso del basso Medioevo, attraverso aspre contese tra opposte fazioni, che resero necessaria la realizzazione di fortificazioni e strutture difensive, fino al XV secolo, quando divenne parte dei possedimenti della repubblica di Venezia. Al declino della Serenissima seguirono varie occupazioni. Rimase sotto il dominio austriaco fino al convegno di Villafranca del 1859, che sancì l'annessione della sue terre al regno piemontese. Nel 1862 vi fece tappa Giuseppe Garibaldi, come ricorda la lapide apposta sul muro dell'edificio che lo ospitò. Nel patrimonio storico-architettonico spiccano la parrocchiale di San Lorenzo, edificata nel XVIII secolo sui resti di un edificio di culto molto più antico, e una piccola chiesa, nota come San Lorenzo Vecchio, per distinguerla dalla parrocchiale e perché è davvero assai antica, probabilmente del IX secolo. A Colognola sono visibili i resti di una torre, unica testimonianza di un antico castello.