Il paese presenta una storia ricca e molto antica: pare infatti che questi territori fossero già abitati in epoca romana, quando molti schiavi venivano qui portati per lavorare nelle vicine miniere di ferro e, una volta esaurita la pena, potevano stabilirsi e coltivare i terreni della zona. Quindi l'origine del nome deriva dal latino Pilia (Pèa in dialetto). Fin dal medioevo in questo piccolo borgo si sviluppò l'arte della lavorazione della lana, tanto che, per descrivere un tipo di tessuto qui prodotto, particolarmente pregiato, venne coniato il nome di Peina. Del periodo medievale restano ruderi, in località Peia alta, di un'antica cittadella, ormai diroccata, costruita a scopi difensivi. Il paese rimase sotto l'amministrazione del vicino Gandino  fino al 1542 , quando vennero unificate tutte le piccole contrade che andarono a comporre Peia. La peculiarità di ognuna di queste sta nel fatto che hanno preso il nome delle famiglie che la abitavano: Cà Bertocchi, Cà Zenucchi, Cà Rottigni, Cà Bosio.